Misi Universitas adalah:

1. Menyelenggarakan Pendidikan Tinggi yang bermutu, berwawasan global dan inklusif di bidang konservasi.
2. Berperan aktif dalam menjawab tantangan nasional dan global di bidang konservasi.
3. Berkontribusi pada peradaban dunia melalui pengembangan keilmuan dan penelitian di bidang konservasi.
4. Berpartisipasi membangun karakter unggul bangsa melalui budaya akademik yang berbudi luhur, inovatif dan professional yang berbasis Al Islam dan KeMuhammadiyahan serta Kearifan Lokal Batiwakkal.